MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 14022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016112	ATT	2	6	1100343	1100348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016112	CCCG	2	8	1100416	1100423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3503	NC_016112	GTT	2	6	1101325	1101330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016112	GCG	2	6	1101414	1101419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_016112	CGGT	2	8	1101640	1101647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_016112	AAAG	2	8	1101721	1101728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016112	TGT	2	6	1101729	1101734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016112	ACAAA	2	10	1101782	1101791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3509	NC_016112	GTT	2	6	1101894	1101899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016112	CAA	2	6	1101992	1101997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_016112	AT	3	6	1102018	1102023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016112	ATAA	2	8	1102026	1102033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016112	A	6	6	1102040	1102045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016112	TTAA	2	8	1102050	1102057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016112	AT	3	6	1102063	1102068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016112	ATT	2	6	1102127	1102132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_016112	ATT	2	6	1102163	1102168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016112	CT	3	6	1102174	1102179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_016112	TTCT	2	8	1102286	1102293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_016112	ATA	2	6	1109939	1109944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016112	GAAT	2	8	1110049	1110056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016112	ACCCAC	2	12	1110130	1110141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_016112	A	6	6	1110265	1110270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016112	CGG	3	9	1110285	1110293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_016112	T	7	7	1110294	1110300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016112	CAA	2	6	1110358	1110363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_016112	TTTA	2	8	1110385	1110392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016112	T	6	6	1110421	1110426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016112	ATTA	2	8	1113035	1113042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016112	TGAC	2	8	1113068	1113075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_016112	GCC	2	6	1113197	1113202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_016112	CGC	2	6	1113203	1113208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_016112	CCG	2	6	1113216	1113221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_016112	TGC	2	6	1113285	1113290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_016112	GCC	2	6	1113590	1113595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_016112	CAA	2	6	1113638	1113643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_016112	CGCC	2	8	1113674	1113681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3538	NC_016112	AGCG	2	8	1113731	1113738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_016112	T	6	6	1114580	1114585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016112	CT	3	6	1114763	1114768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_016112	TGA	2	6	1114884	1114889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016112	TGT	2	6	1114902	1114907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016112	CGG	2	6	1115034	1115039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_016112	GCC	2	6	1115048	1115053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_016112	CAA	2	6	1115109	1115114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_016112	TTAT	2	8	1115134	1115141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016112	CAAA	2	8	1115751	1115758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_016112	TTG	2	6	1115771	1115776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_016112	TAA	2	6	1115826	1115831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016112	ATT	2	6	1115848	1115853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016112	AGG	2	6	1115914	1115919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_016112	TCT	2	6	1115924	1115929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016112	TAA	2	6	1116492	1116497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016112	GA	3	6	1116539	1116544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016112	TAT	2	6	1117811	1117816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016112	T	6	6	1117874	1117879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016112	GAT	2	6	1118347	1118352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016112	GCG	2	6	1118354	1118359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_016112	TTCC	2	8	1118370	1118377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_016112	AGG	2	6	1119106	1119111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016112	CCAT	2	8	1119187	1119194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_016112	GCTA	2	8	1119234	1119241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_016112	TA	3	6	1119255	1119260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016112	TTG	2	6	1119262	1119267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016112	GGC	2	6	1119292	1119297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_016112	CAA	2	6	1119329	1119334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_016112	AGTT	2	8	1119335	1119342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016112	CAG	2	6	1119354	1119359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_016112	GCA	2	6	1119426	1119431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_016112	GCC	2	6	1119439	1119444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_016112	ATGG	2	8	1119453	1119460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016112	ACA	2	6	1119488	1119493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016112	AT	3	6	1119807	1119812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_016112	CCCT	2	8	1119869	1119876	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3575	NC_016112	TTAAG	2	10	1119967	1119976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_016112	GTG	2	6	1119983	1119988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016112	CTTAA	2	10	1120075	1120084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3578	NC_016112	GC	3	6	1120137	1120142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_016112	A	6	6	1120306	1120311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016112	A	6	6	1120446	1120451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_016112	GCA	2	6	1120498	1120503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_016112	ATGG	2	8	1120577	1120584	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016112	CGG	2	6	1120590	1120595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_016112	AC	3	6	1120606	1120611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_016112	TCAA	2	8	1120640	1120647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_016112	A	6	6	1121989	1121994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016112	GCA	2	6	1122040	1122045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_016112	TCAA	2	8	1122263	1122270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_016112	GA	3	6	1122320	1122325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_016112	GAG	2	6	1122397	1122402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_016112	CGT	2	6	1122846	1122851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_016112	AGG	2	6	1123057	1123062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016112	CCT	2	6	1123245	1123250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_016112	TCG	2	6	1123367	1123372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_016112	G	7	7	1123395	1123401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_016112	CGGTT	2	10	1123444	1123453	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3597	NC_016112	AAT	2	6	1124289	1124294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_016112	TAT	3	9	1124304	1124312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016112	ATTT	2	8	1124327	1124334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016112	GTT	2	6	1125079	1125084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016112	AGCA	2	8	1125089	1125096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_016112	ATT	2	6	1125109	1125114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016112	AAG	2	6	1125120	1125125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016112	ACA	2	6	1125313	1125318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_016112	TTC	2	6	1125345	1125350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_016112	AGG	2	6	1125360	1125365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_016112	TTG	2	6	1125372	1125377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_016112	TGG	2	6	1125444	1125449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016112	CGG	2	6	1125466	1125471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_016112	GCC	2	6	1125480	1125485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_016112	CTA	2	6	1125549	1125554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_016112	TTTA	2	8	1125588	1125595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016112	TGT	2	6	1125602	1125607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016112	ATT	2	6	1125635	1125640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016112	C	6	6	1125646	1125651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3616	NC_016112	CGGTT	2	10	1125728	1125737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3617	NC_016112	GTAC	2	8	1125766	1125773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_016112	AAT	2	6	1125810	1125815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016112	CGC	2	6	1125857	1125862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_016112	ATTA	2	8	1125960	1125967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016112	GGTCG	2	10	1126928	1126937	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3622	NC_016112	TTAC	2	8	1127963	1127970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_016112	CTA	2	6	1128023	1128028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_016112	CGG	2	6	1128139	1128144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_016112	GCC	2	6	1128153	1128158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_016112	CAA	2	6	1128193	1128198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_016112	A	6	6	1128213	1128218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016112	TTAT	2	8	1128224	1128231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016112	CTG	2	6	1128250	1128255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_016112	CGG	2	6	1128573	1128578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_016112	CGG	2	6	1128603	1128608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_016112	A	6	6	1128613	1128618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_016112	CAA	2	6	1128694	1128699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3765	NC_016112	CAT	2	6	1200859	1200864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3785	NC_016112	TCATA	2	10	1207231	1207240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3786	NC_016112	T	6	6	1207592	1207597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3796	NC_016112	ATCG	2	8	1211296	1211303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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